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两个法院都有管辖权的刑事案件如何处理?

　　两个以上同级人民法院都有权管辖的案件，一般由最初受理的人民法院管辖。如果无法确定谁最先受理的，可以协商解决。如果协商不成的，可以由各方的共同上一级人民法院指定管辖。

　　相关法律可参考：《刑事诉讼法解释》第十六条 两个以上同级人民法院都有权管辖的案件，由最初受理的人民法院管辖。尚未开庭审判的，在必要的时候，可以移送被告人主要犯罪地的人民法院审判。两个以上同级人民法院对管辖权发生争议的，应当在审限内协商解决;协商不成的，由最初受理案件的人民法院报请争议各方共同的上一级人民法院指定管辖。